水污染控制、环境生物技术、水体微生态过程与调控

1. 2024年至2026年，微生物拮抗作用驱动锰氧化—机理与普遍，国家自然科学基金原创探索延续资助项目，负责人

2. 2024年至2028年，面向生态安全的水清洁技术，国家自然科学基金基础科学中心项目，子课题负责人

3. 2024年至2025年，氨氮在北京河流区域大气-水-沉积物的循环过程与分配机制，国重联合实验室自由申请课题，任务负责人

4. 2023年至2027年，再生水生态风险产生机制与安全阈值，国家自然科学基金重大项目，子课题负责人

5. 2023年至2023年，微生物相互作用驱动锰氧化—机理与普遍性，国家自然科学基金原创探索项目，负责人

6. 2021年至2025年，微生物-物化耦合系统处理新污染物技术，国家重点研发计划课题，负责人

7. 2022年至2022年，科学传播类：北京河流水生态系统调查与分析，国家自然科学基金科普类专项项目，负责人

8. 2022年至2023年，不同消毒工艺尾水对受纳河流微生物群落的影响机制研究，国重联合实验室自由申请课题，任务负责人

9. 2021年至2022年，抗疫消毒剂使用对长江微生物群落结构与功能的影响，国重联合实验室自由申请课题，任务负责人

10. 2019年至2020年，典型流域磷污染管控方案及应用，国家长江生态环境保护修复联合研究中心，任务负责人

11. 2019年至2022年，长江重点江段特征污染物识别及其生态风险，中国长江三峡集团有限公司，任务负责人

12. 2018年至2019年，程海湖水环境综合治理与保护总体规划，云南永胜县人民政府，任务负责人

13. 2020年至2021年，工业废水中典型污染物的生物转化与生态效应，中国科学院环境生物技术重点实验室项目，任务负责人

14. 2018年至2021年，饮用水砂滤池微生态功能解析及强化，国家自然科学基金面上项目，负责人

15. 2016年至2017年，基于水循环系统的供排水风险评估与应急供水策略研究，国家重点研发计划课题，负责人

16. 2016年至2019年，着生生物群落对污水厂排水的水质响应与工艺反馈研究，国家自然科学基金面上项目，负责人

17. 2016年至2020年，饮用水复合污染风险因子识别与控制原理，中国科学院前沿探索项目，任务负责人

18. 2016年至2018年，京津冀环境多介质复合污染协同消减与调控，中国科学院重点部署项目，课题负责人

19. 2015年至2017年，饮用水放射性污染控制技术及应急装备研发，国家水体污染控制与治理科技重大专项，子课题负责人

20. 2014年至2016年，巢湖市水源优化与水质保障技术研究与示范，国家水体污染控制与治理科技重大专项，任务负责人

21. 2014年至2016年，地下水环境质量基准、标准制定的方法学和关键技术预研究，环保公益性行业科研专项，子课题负责人

22. 2019年至2023年，基于河岸过滤的饮用水无药剂净化新技术原理，国家自然科学基金重点国际合作研究项目，主要参与人

23. 2012年至2014年，饮用水除锑及砷锑同时去除技术与应用示范，科技部863，主要参与人

24. 2015年至2019年，污水处理厂排放微量污染物共暴露条件下的河流生态效应，国家自然科学基金重点国际合作研究项目，主要参与人

25. 2013年至2017年，国家自然科学基金重大项目“饮用水质复合污染过程与调控原理”课题二“典型复合污染水质净化关键技术及工艺基础”，主要参与人

26. 2011年至2012年，锰氧化细菌的生物强化作用及机理探讨，环境水质学国家重点实验室青年人才项目，负责人

27. 2011年至2013年，利用分子生态技术解析滇池污染水体的硝化反硝化菌群结构变化，国家自然科学基金青年科学基金项目，负责人

28. 2009年，博士后特别资助项目/北京大学优秀博士后，中国博士后基金，负责人

29. 2008年，十一五水体污染控制与治理科技重大专项滇池项目第2课题，十二五滇池项目筹划，主要参与人

30. 2008年，国家自然科学基金项目“处理氮杂环芳烃化合物废水的SBR中菌群结构与功能基因研究”（50878001），主要参与人

31. 2007年，废水处理系统中质粒转移对吡啶降解的促进作用，北京市自然科学基金项目，主要参与人

32. 2006年，治理含氮杂环芳烃污染的基因强化技术研究，科技部863探索导向类课题，主要参与人

33. 2004年，可移动遗传因子在污染体系中的水平基因转移与基因强化技术研究，科技部863前沿探索类课题，主要参与人

34. Bioremediation of uranium in contaminated groundwater (Princeton)，主要参与人

35. Nitrogen cycling in urban storm-water detention ponds (Princeton)，主要参与人

36. Iron reduction by pure Geobacter sulfureducens strains (Princeton)，主要参与人

37. 天津信汇制药有限公司污水处理中试，主要参与人

38. 处理高浓度氨氮废水的生物沸石反应器开发研究，主要参与人

39. 河道水质净化强化技术研究与工程示范，主要参与人

40. 生物强化处理焦化废水试验研究，主要参与人

1. 2024年，《环境工程》期刊优秀审稿人奖（2023-2024）

2. 2023年，Frontiers of Environmental Science & Engineering期刊最佳论文奖

3. 2022年，“程海湖水环境综合治理与保护总体规划（2018-2035年）咨询”项目，中国科技咨询协会咨询项目创新奖

4. 2016年，Journal of Environmental Sciences期刊最佳审稿人奖

代表性论文

1. Jie Mao, Qiaojuan Wang, Xijuan Wang, Sha Shi, Yaohui Bai*, Jiuhui Qu. Characterization of Aquatic Acinetobacter baumannii during the COVID-19 Outbreak in Wuhan, China. ACS ES&T WATER 2025, 5(5):2373-2380

2. Hui Lin, Donglin Wang, Qiaojuan Wang, Jie Mao, Lutong Yang, Yaohui Bai*, Jiuhui Qu. Epigenetic modifications and metabolic gene mutations drive resistance evolution in response to stimulatory antibiotics. MOLECULAR SYSTEMS BIOLOGY 2025, 21(3):s44320-025-00087-4.

3. Lutong Yang#, Ping Han#, Qiaojuan Wang, Hui Lin, Donglin Wang, Jie Mao, Weixiao Qi, Yaohui Bai*, Jiuhui Qu. Disinfectant-induced ammonia oxidation disruption in microbial N-cycling process in aquatic ecosystem after the COVID-19 outbreak. WATER RESEARCH 2024; 258:121761.

4. Donglin Wang#, Jiayu Shang#, Hui Lin, Jinsong Liang, Chenchen Wang, Yanni Sun*, Yaohui Bai*, Jiuhui Qu. Identifying ARG-carrying bacteriophages in a lake replenished by reclaimed water using deep learning techniques. WATER RESEARCH 2024, 248:120859.

5. Hui Lin, Donglin Wang, Qiaojuan Wang, Jie Mao, Yaohui Bai*, Jiuhui Qu. Interspecific Interactions Facilitate Coexistence of Kin Bacteria Against Antibiotic Perturbations in Unstructured Habitats. THE ISME JOURNAL 2024, 18(1):wrad038.

6. Hui Lin, Xue Ning, Donglin Wang, Qiaojuan Wang, Yaohui Bai*, Jiuhui Qu. Quorum-sensing gene regulates hormetic effects induced by sulfonamides in Comamonadaceae. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 2023, 89(12):01162-23.

7. Qiaojuan Wang, Junwen Chen, Weixiao Qi, Donglin Wang, Hui Lin, Xinghua Wu, Dianchang Wang, Yaohui Bai*, Jiuhui Qu. Dam construction alters planktonic microbial predator？prey communities in the urban reaches of the Yangtze River. WATER RESEARCH 2023, 230:119575.

8. Junwen Chen#, Weixiao Qi#, Donglin Wang#, Qiaojuan Wang, Hui Lin, Guannan Mao, Jinsong Liang, Xue Ning, Yaohui Bai*, Huijuan Liu, Jiuhui Qu*. Disruption and recovery of river planktonic community during and after the COVID-19 outbreak in Wuhan, China. ISME COMMUNICATIONS 2022, 2:84.

9. Yaohui Bai*, Jiuhui Qu*. Manganese oxides in Phragmites rhizosphere accelerates ammonia oxidation in constructed wetlands. WATER RESEARCH 2021, 205:117688.

10. Chenchen Wang, Guannan Mao, Kailingli Liao, Weiwei Ben, Meng Qiao, Yaohui Bai*, Jiuhui Qu. Machine learning approach identifies water sample source based on microbial abundance. WATER RESEARCH 2021 199:117185.

11. Wanchao Hu#, Jinsong Liang#, Feng Ju, Qiaojuan Wang, Ruiping Liu, Yaohui Bai*, Huijuan Liu, Jiuhui Qu. Metagenomics Unravels Differential Microbiome Composition and Metabolic Potential in Rapid Sand Filters Purifying Surface Water Versus Groundwater. ENVIRONMENTAL SCIENCE & TECHNOLOGY 2020, 54(8):5197-5206.

12. Jinsong Liang, Guannan Mao, Xiaole Yin, Liping Ma, Lei Liu, Yaohui Bai*, Tong Zhang, Jiuhui Qu. Identification and quantification of bacterial genomes carrying antibiotic resistance genes and virulence factor genes for aquatic microbiological risk assessment. WATER RESEARCH 2020, 168:115160.

13. Yangyang Chang, Yaohui Bai*, Yang Huo, Jiuhui Qu. Benzophenone-4 Promotes the Growth of a Pseudomonas sp. and Biogenic Oxidation of Mn(II). ENVIRONMENTAL SCIENCE & TECHNOLOGY 2018, 52(3):1262-1269.

14. Jinsong Liang#, Yaohui Bai#, Yujie Men, Jiuhui Qu*. Microbe-microbe interactions trigger Mn(II)-oxidizing gene expression. The ISME JOURNAL 2017, 11(1):67-77.

15. Yaohui Bai, Yangyang Chang, Jinsong Liang, Chen Chen, Jiuhui Qu*. Treatment of groundwater containing Mn(II), Fe(II), As(III) and Sb(III) by bioaugmented quartz-sand filters. WATER RESEARCH 2016, 106:126-134.

16. Yaohui Bai, Tingting Yang, Jinsong Liang, Jiuhui Qu*. The role of biogenic Fe-Mn oxides formed in situ for arsenic oxidation and adsorption in aquatic ecosystems. WATER RESEARCH 2016, 98:119-127.